Wat zijn de verschillende soorten wetenschappelijke workflows?

Wetenschappelijke workflows worden gebruikt om de manier te verbeteren waarop onderzoek wordt uitgevoerd.De meest voorkomende typen richten zich op laboratoriumworkflows, computationele workflows en workflows voor gegevensanalyse.Veel instellingen ontwikkelen wetenschappelijke workflows om fouten te verminderen, de resultaten te verbeteren en de ontdekking van snelheden te verbeteren.Workflows zijn vaak op maat ontworpen om te werken voor specifieke studies en kunnen variëren per industrie en het type gegevens dat moet worden verzameld en geanalyseerd.

Wetenschappelijke workflows voor het lab kunnen verschillende aspecten van operaties behandelen.In veel instellingen zijn er specifieke workflows om een te testen monster voor te bereiden.Een ziekenhuiskliniek kan bijvoorbeeld goed gedefinieerde procedures hebben voor het verwerven van een patiëntmonster, het inloggen van dat monster, het volgen met een scanner en barcode, het opslaan en voorbereiden op onderzoek.In dit geval kan de wetenschappelijke workflow een combinatie van schriftelijke procedures zijn om te volgen en computersoftware die het monster van verzameling naar onderzoek volgt.Informatie over een monstersstatus wordt vaak beschikbaar gesteld via een webportal voor gemakkelijke toegang.Laboperaties gebruiken ook workflows om te helpen garanderen dat de nodige materialen beschikbaar zijn, zoals chemische reagentia die nodig zijn om een test uit te voeren, op voorraad zijn en beschikbaar zijn wanneer een experiment wordt uitgevoerd.

Een andere vorm van wetenschappelijke workflow voor het laboratorium heeft betrekking op het uitvoeren van het eigenlijke experiment.Een onderzoeker wil bijvoorbeeld een bepaald gebied van de hemel fotograferen of het DNA van een bepaalde cel sequenties.In beide gevallen zou een workflow de stappen dicteren die een onderzoeker zou volgen om de observatie te voltooien.Astronomen zouden bijvoorbeeld de coördinaten moeten krijgen van de regio die ze willen bestuderen, die gegevens in het volgsysteem van de telescoop invoeren en een digitale camera positioneren om een afbeelding vast te leggen.Dergelijke workflows kunnen door een instelling worden gebruikt om tijd op speciale apparatuur te plannen om ook een optimaal gebruik van die apparatuur te garanderen.

Veel onderzoek wordt vandaag gedaan door computermodellering en simulatie.Wetenschappelijke workflows voor dit soort onderzoek kunnen procedures omvatten voor het maken van het programma, het oplossen van problemen en het indienen en uitvoeren van deze computationele taken.In veel laboratoria kan een onderzoeker online een baan indienen bij een computercentrum.Taken worden vervolgens automatisch gepland op basis van verschillende factoren, waaronder prioriteitsniveau, beschikbare bronnen en hoe lang de taak zal worden uitgevoerd.In de meeste gevallen is informatie -informatie over de taakstatus online beschikbaar, dus degenen die een baan hebben ingediend, kunnen snel de status controleren om te zien of deze gepland is om te draaien, te gebruiken of voltooid te worden.

Zodra een experiment is voltooid, een laboratoriumtest is voltooid of een computersimulatie wordt uitgevoerd, is er vaak behoefte aan een ander type wetenschappelijke workflow om de verzamelde gegevens te analyseren.Vaak is de eerste stap in een dergelijke wetenschappelijke analyseworkflow om de gegevens uit een specifieke database, bestand of website te extraheren.De gegevens moeten vervolgens in een goed formaat worden geplaatst.Dit kan zoiets eenvoudigs zijn als het omzetten van een temperatuurlezing in Fahrenheit naar Celsius of een afstandsmeting van voeten tot mijlen.De gegevens worden vervolgens uitgevoerd via een analyseroutine en moeten mogelijk worden vergeleken met andere gegevens.De uiteindelijke resultaten worden vervolgens gepresenteerd aan de onderzoeker, meestal in de vorm van een rapport, een bestand of een visueel display.

In al dit soort wetenschappelijke workflows is het voordeel dat onderzoeken gestandaardiseerde manieren hebben om hun werk uit te voeren.In sommige gevallen kan automatisering worden toegepast op sommige stappen in een workflow.Automatisering helpt om werk van de onderzoeker te laden en het proces te versnellen.