Wat is genoom -annotatie?

Genoom annotatie tags secties van een genoom met informatie over de genetische gegevens die het bevat.Dit maakt deel uit van het proces bij genoomprojecten, waarbij het doel niet alleen is om het DNA van een doelorganisme te sequencen, maar ook te begrijpen wat het doet en hoe het functioneert.Onderzoekers kunnen annotatie in hun laboratoria uitvoeren en kunnen gegevens delen met andere wetenschappers om middelen en informatie te bundelen.Online databases die openstaan voor het publiek zijn beschikbaar, en sommigen staan ook leden van het grote publiek toe hun eigen annotaties in te dienen.

De eerste stap in genoomnotatie is sequencing, waarbij onderzoekers de volgorde van aminozuren bepalen in een DNA van de organismen.Het sequencen van een heel genoom duurt lang, en het is gebruikelijk dat wetenschappers beginnen te annoteren voordat het genoom is gedecodeerd.Met een deel van de sequentie -DNA in de hand, kan een onderzoeker beginnen met annoteren.Wetenschappers kunnen opmerken waar genen lijken te starten en te stoppen en aandacht te schenken aan onderscheidende DNA -snaren die informatie bevatten over de functie van het genoom.

Computers kunnen zelf een genoomanotatie uitvoeren.Ze kunnen bekende patronen zoeken, zoals snaren van aminozuren die aan het begin en einde van genen verschijnen.In geautomatiseerde annotatie kan de computer notities toevoegen aan verschillende secties van een reeks DNA om hierover informatie te verstrekken.Het is ook mogelijk om segmenten van verschillende organismen te vergelijken om naar variantie te zoeken die belangrijke informatie over de soort als geheel kan bieden.

ann annotatie van handmatige genoom omvat het fysiek herzien van het DNA.Veel onderzoekers gebruiken computers om de informatie weer te geven en te taggen, waardoor ze deze in databases kunnen invoeren terwijl ze werken.In sommige gevallen kan een handmatige beoordeling nodig zijn na geautomatiseerde annotatie, om ervoor te zorgen dat de computer de informatie correct heeft gekregen.Dit kan een nauwgezet proces zijn en er komen fouten voor, wat een reden is waarom onderzoekers databases graag poolen.Als een annotatie niet overeenkomt met anderen op hetzelfde DNA -gedeelte, kunnen mensen de informatie evalueren om te bepalen wat er is gebeurd en de fout vast te stellen.

Het is niet altijd mogelijk om te bepalen wat een gen doet tijdens het genoom -annotatieproces.Wetenschappers kunnen genen markeren en ze scheiden van andere componenten van het genoom, zoals niet-coderende DNA-achtige herhalingen.Deze informatie kan in onderzoek worden gebruikt, omdat mensen theorieën ontwikkelen over verschillende segmenten van het genoom.Ze kunnen toevoegen aan de annotaties om de functie van een gen op te merken.